Synamatix gibt Bereitstellung von Bioinformatik-Lösungen für Sequenzierer der zweiten Generation bekannt

Kuala Lumpur, Malaysia (ots/PRNewswire) -

Synamatix gab heute die Herausgabe zweier neuer
Softwareanwendungen bekannt, die speziell auf die Verarbeitung und
Auswertung der Daten grossangelegter, mit DNA-Sequenzier-Plattformen
der zweiten Generation durchgeführter Re-Sequenzierungsprojekte
ausgerichtet sind.

Robert Hercus, Generaldirektor von Synamatix, kommentierte:
"SXOligosearch(TM) und eine modifizierte Version von SynaSearch(TM)
wurden herausgebracht, um die explodierenden Datenfluten zu
beherrschen, die durch den zunehmenden Einsatz der
DNA-Sequenzier-Plattformen von 454-Roche und Solexa-Illumina
entsteht. Die Anwendungen wurden im Rahmen unserer Strategie
entwickelt, eine Reihe von Hochdurchsatz-Anwendungen für die
Verarbeitung, Auswertung und Integration von Daten für alle Arten von
DNA-Sequenzierern der zweiten Generation bereitzustellen."

Die erste Anwendung, SXOligosearch, wurde dazu entwickelt kurze
Abbildungen, wie Auslesungen vom Genomsequenzierer von
Solexa-Illumina oder von Oligonukleotid-Mikroarrays Proben zu
erfassen. SXOligosearch bietet ein hohes Mass an Flexibilität, da die
Software in der Lage ist, eine ganze Reihe von Auslesefehlern bzw.
Mutationen zu handhaben. Darüber hinaus bietet sie, verglichen mit
herkömmlichen Tools, eine über 100-fach höhere Leistung. Im Gegensatz
zu anderen Standard-Alignment-Tools der Branche erstellt
SXOligosearch Alignments komplette Auslesungen und nicht nur von
HSPs, was zu einer höheren Spezifizität und Sensitivität führt. Die
Software kann auch Auslesungen niedriger Qualität mit zahlreichen
Falschzuordnungen, Einsetzungen oder Löschungen mit hoher Genauigkeit
und überlegener Leistung handhaben.

Darüber hinaus wurde auch eine neue, modifizierte Version von
SynaSearch herausgebracht, die Auslesungen der GS20- und
FLX-Plattformen von 454 verarbeiten und abbilden kann. Die behutsam
durchgeführte Optimierung hat im Vergleich zu Standardansätzen zu
einer höheren Genauigkeit, Spezifizität und einer 200-fachen
Leistungsverbesserung geführt.

Wenn SynaBASE(TM) als gemeinsame Plattform zum Einsatz kommt,
können verschiedene Auslesearten gemischt werden, sodass die
Erfassung vergrössert und die zwischen Datensätzen identifizierten
Unterschiede besser unterstützt werden.

Zu Synamatrixs anderen Hochleistungsanwendungen, die auf SynaBASE
- ihrer einzigartigen, strukturierten Netzwerk-Datenbankplattform -
beruhen, gehören SynaTree(TM), SXPRESearch(TM) und SXProbeDB(TM).

Informationen zu Synamatix

Die allen Synamatix Softwareanwendungen zugrunde liegende
Technologie ist die firmeneigenen "SynaBASE"-Plattform. Die mithilfe
dieser Datenbank-Plattform erstellten Anwendungen zeichnen sich durch
bedeutend bessere Skalierbarkeit, Sensitivität und Leistungsfähigkeit
aus. Synamatix ist ein in privater Hand befindliches
Bioinformatik-Unternehmen der nächsten Generation, das sein
Schwergewicht darauf legt, seine Kerntechnologie kontinuierlich
weiter zu erforschen und zu entwickeln, neue Softwareanwendungen
bereitzustellen und den Kundenstamm in den USA, Europa, Asien und
Australien zu unterstützen.

Ansprechpartner
Patricia Chan
Marketing und Communications
Synamatix Sdn. Bhd.
Tel.: +60-3-2283-1820
E-Mail: enquiries@synamatix.com
www.synamatix.com

Webseite: http://www.synamatix.com

Originaltext: Synamatix
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+60-3-2283-1820, E-Mail: enquiries@synamatix.com